RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 LAYNQ6UX15 382 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DBX2Q6ZNG2 339 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 NIF3L1Q9GZT8 377 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MMRN2Q9H8L6 949 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TM9SF3Q9HD45 589 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 USP3Q9Y6I4 520 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DKK1O94907 266 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FSBPO95073 299 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM215Q68D42 235 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CPXM2Q8N436 756 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF366Q8N895 744 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0895Q8NCT3 520 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC150Q8NCX0 1101 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 DCBLD2Q96PD2 775 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID3AQ99856 593 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G4CQ9UP65 541 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF10Q6WRI0 2623 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IKBKBO14920 756 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN3O60637 253 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA4FO95754 770 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 INAVAQ3KP66 663 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
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CAPNS1-217ENST00000629983 MYH10P35580 1976 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIA4P48058 902 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ME1P48163 572 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 GCLMP48507 274 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 VAMP7P51809 220 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IL9RQ01113 521 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 MPPE1Q53F39 396 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS13Q6UX07 377 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF8Q969P0 613 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PLD4Q96BZ4 506 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CRELD1Q96HD1 420 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD10Q9H3F6 313 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 FTSJ1Q9UET6 329 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 H0Y8X5 98 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PDXKO00764 312 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 DNTTP04053 509 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM49P0CI25 452 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM49CP0CI26 452 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf220Q5T0J3 134 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SCUBE3Q8IX30 993 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS1R2Q8TE23 839 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CALUO43852 315 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRC4O43908 158 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCG1P45844 678 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMK2BQ13554 666 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KMT5BQ4FZB7 885 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST9Q7L1S5 443 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 BIRC7Q96CA5 298 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SERTAD1Q9UHV2 236 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 HARS2P49590 506 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAT1P54687 386 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C21orf59P57076 290 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC8A3P57103 927 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 GANCQ8TET4 914 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OSGEPQ9NPF4 335 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCB8Q9NUT2 735 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WV48 116 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA12O60330 932 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT13P13646 458 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CD27P26842 260 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRNQ16849 979 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 RESP18Q5W5W9 173 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGZQ86VD9 579 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM174Q8WUU8 243 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM245Q9H330 911 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 FBRSQ9HAH7 460 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA7Q9UN72 937 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRBP23467 1997 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-FP30511 346 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS14P62263 151 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM217AQ8IXS0 508 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GGA2Q9UJY4 613 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC400499M0QZD8 3231 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM47DPA6NHR8 397 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PLK4O00444 970 aa28.56■■■□□ 2.16
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