RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PAQR9Q6ZVX9 377 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 MIB1Q86YT6 1006 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6B3Q8NGW1 331 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SPACA7Q96KW9 195 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX25Q9H3E2 840 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP192Q8TEP8 1941 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ITPR1Q14643 2758 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 USP27XA6NNY8 438 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 UPK3BL1B0FP48 263 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 UPK3BL2E5RIL1 263 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM24O15164 1050 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TNNI1P19237 187 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 APBA1Q02410 837 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ASIC2Q16515 512 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1211LQ6NV74 962 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SLITRK1Q96PX8 696 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK16Q96T55 309 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC400499M0QZD8 3231 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRG2P18507 467 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX5P35711 763 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 PGFP49763 221 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR72Q3MJ13 1102 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 LYSMD4Q5XG99 296 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP93Q8N1F7 819 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN10Q9HC96 672 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQF6 199 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM92AA1XBS5 289 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 F8VZ95 297 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K13O43283 966 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 GREM1O60565 184 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TULP3O75386 442 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 YWHAQP27348 245 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 MFAP3P55082 362 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 MYL6P60660 151 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM193AP78312 1265 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 GCNT1Q02742 428 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL30Q0D2K2 578 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT16Q8N8M0 369 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA4DQ92854 862 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUB2Q96DC9 234 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5C1BQ96P26 610 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK13Q9UKR3 277 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXD12P35452 270 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 GAD2Q05329 585 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM25Q86YD3 366 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO32Q969P5 355 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPNS1P04632 268 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SPA17Q15506 151 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB119Q8N690 84 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TERB1Q8NA31 727 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MXQ7 604 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBP50607 506 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A3P53794 718 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH8P55286 799 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 HECTD3Q5T447 861 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM35AQ86V20 835 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMIZ2Q8NF64 920 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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