RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 LRRC3Q9BY71 257 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 WDCPQ9H6R7 721 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TLE6Q9H808 572 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 IL21Q9HBE4 155 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ASAH2Q9NR71 780 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PIGVQ9NUD9 493 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 OSER1Q9NX31 292 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.058e-7■■■■□ 24.8
KDM5B-210ENST00000602511 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FZD10Q9ULW2 581 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.5□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 LRRD1A4D1F6 860 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GPR37L1O60883 481 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SRGAP2O75044 1071 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TJP3O95049 919 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 APOEP02649 317 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FGGP02679 453 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CTAGE8P0CG41 777 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PYGMP11217 842 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TCF4P15884 667 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 EPCAMP16422 314 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PTPN2P17706 415 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 WEE1P30291 646 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 L1CAMP32004 1257 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CXCR5P32302 372 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ADRA1BP35368 520 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 COG7P83436 770 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FOXK2Q01167 660 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SEMA3BQ13214 749 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CYP1B1Q16678 543 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FAM131BQ86XD5 332 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TTC13Q8NBP0 860 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KCTD6Q8NC69 237 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GPR152Q8TDT2 470 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TSC1Q92574 1164 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RUBCNQ92622 972 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MARVELD3Q96A59 401 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 C1orf74Q96LT6 269 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF576Q9H609 170 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZWILCHQ9H900 591 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DONSONQ9NYP3 566 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RAD54BQ9Y620 910 aa8.49□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 H3BRJ5 948 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF197O14709 1029 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF185O15231 689 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NUDT7P0C024 238 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TCF3P15923 654 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TGM2P21980 687 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GABRR2P28476 465 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 HOXC13P31276 330 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ARL4AP40617 200 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PGFP49763 221 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DNA2P51530 1060 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CDR1P51861 262 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 EMP3P54852 163 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CDH6P55285 790 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TBX4P57082 545 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SLC7A9P82251 487 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms