RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CXorf38	Q8TB03	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GMIP	Q9P107	970 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763		C9IYK1	514 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CDH16	O75309	829 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	UROD	P06132	367 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SLC11A1	P49279	550 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	IRAK1	P51617	712 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62	5e-16	■■■■■ 28.2
ILF3-222	ENST00000592763	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MFSD11	O43934	449 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TSPAN3	O60637	253 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NBN	O60934	754 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ITGAV	P06756	1048 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MX2	P20592	715 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TBX4	P57082	545 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	LHX8	Q68G74	356 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	IL31	Q6EBC2	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CDKL2	Q92772	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CIT	O14578	2027 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DNM1L	O00429	736 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DAB1	O75553	588 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PSMD5	Q16401	504 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SUSD3	Q96L08	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CSF2RA	P15509	400 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TGM2	P21980	687 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	L1CAM	P32004	1257 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GABRB2	P47870	512 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	IFT88	Q13099	833 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PLD1	Q13393	1074 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	STAT4	Q14765	748 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763		H7C4K7	107 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PTPN9	P43378	593 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	GGT7	Q9UJ14	662 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	LRIG2	O94898	1065 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	CKM	P06732	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	SYN1	P17600	705 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PSMB4	P28070	264 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	PRMT2	P55345	433 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-222	ENST00000592763	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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