RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 PRSS16Q9NQE7 514 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 CLSTN1O94985 981 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 JUPP14923 745 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 CD27P26842 260 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 TXLNAP40222 546 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 ACADVLP49748 655 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 ASIC1P78348 528 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 CLDN10P78369 228 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 HES3Q5TGS1 186 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 UCMAQ8WVF2 138 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 NXPE2Q96DL1 559 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 USP3Q9Y6I4 520 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 AK5Q9Y6K8 562 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 E9PAM4 449 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 NPC1O15118 1278 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 KRT10P13645 584 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 BNIP3Q12983 259 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 TEAD4Q15561 434 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 FAM217AQ8IXS0 508 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 SAP25Q8TEE9 199 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 TNMDQ9H2S6 317 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRS-208ENST00000590509 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 BRINP1O60477 761 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 CHKAP35790 457 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 KCNJ12Q14500 433 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 RTP5Q14D33 572 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 SLC39A14Q15043 492 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 CPXM2Q8N436 756 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF276Q8N554 614 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 EID2Q8N6I1 236 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 DDI1Q8WTU0 396 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 TSC1Q92574 1164 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 DHX58Q96C10 678 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 MYO19Q96H55 970 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ARID3AQ99856 593 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 SLC12A8A0AV02 714 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 C10orf142B7Z368 130 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 EXOC3O60645 756 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 RFPL3O75679 317 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 KIF20AO95235 890 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 CFHR1Q03591 330 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 TLE3Q04726 772 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ZACNQ401N2 412 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 CHST9Q7L1S5 443 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 UNC93AQ86WB7 457 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 DOCK9Q9BZ29 2069 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PR77 199 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 TULP2O00295 520 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 VILLO15195 856 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 HLA-DRAP01903 254 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 CXADRP78310 365 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 COG7P83436 770 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 INCA1Q0VD86 236 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 SV2AQ7L0J3 742 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 GPR155Q7Z3F1 870 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ERICH1Q86X53 443 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 SPACA3Q8IXA5 215 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 DMAC2Q9NW81 257 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PPC4 97 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 J3QKU1 62 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRS-208ENST00000590509 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms