RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PFKLP17858 780 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 VIPR2P41587 438 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2HP62256 183 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ST3GAL1Q11201 340 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GRM4Q14833 912 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 INSCQ1MX18 579 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BTBD16Q32M84 506 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM60Q495X7 471 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC152Q4G0S7 254 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GAGE13Q4V321 117 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AGBL4Q5VU57 503 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKS6Q68DC2 871 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZUG5 572 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD23Q86SG2 305 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CMTM4Q8IZR5 234 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NECAB1Q8N987 351 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMIZ2Q8NF64 920 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MZB1Q8WU39 189 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 LPIN2Q92539 896 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 C3orf49Q96BT1 292 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MED15Q96RN5 788 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MPHOSPH8Q99549 860 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 REEP2Q9BRK0 252 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PANK2Q9BZ23 570 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10A2Q9H208 303 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A15Q9H2J7 730 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNK12Q9HB15 430 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NCDNQ9UBB6 729 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HESX1Q9UBX0 185 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HPSEQ9Y251 543 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.58□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ELP1O95163 1332 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMYM6O95789 1325 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MYH6P13533 1939 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CDHR4A6H8M9 788 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AQP7P3A6NL99 342 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 E7EVH7 732 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BQV1 296 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PJA2O43164 708 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GPAA1O43292 621 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AHCYL1O43865 530 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PLOD3O60568 738 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PFKFB2O60825 505 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 POMCP01189 267 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ARP10275 920 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ALAS1P13196 640 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC5A2P31639 672 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT20P35900 424 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 POLD2P49005 469 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TERF1P54274 439 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RRADP55042 308 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CLRN1P58418 232 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RAP2BP61225 183 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HGFACQ04756 655 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ITPK1Q13572 414 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP1A4Q13733 1029 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBR1Q16650 682 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MANEALQ5VSG8 457 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SUSD4Q5VX71 490 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG16L1Q676U5 607 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.57□□□□□ -1.68
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