RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PRRT4C9JH25 899 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ATG13O75143 517 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ENDOD1O94919 500 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 FERP16591 822 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 MATKP42679 507 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ANO4Q32M45 955 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 DCAF6Q58WW2 860 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 EMC10Q5UCC4 262 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TSSK4Q6SA08 328 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 AGPAT1Q99943 283 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.13■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 A0A1W2PQJ5 194 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 I6L893 689 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 DAB1O75553 588 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SERPINC1P01008 464 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 APODP05090 189 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 C7P10643 843 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 UBASH3AP57075 661 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ENPP2Q13822 863 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 MPPE1Q53F39 396 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 C2CD6Q53TS8 623 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 NAA35Q5VZE5 725 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 IL17RCQ8NAC3 791 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ADAM32Q8TC27 787 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 FAM122AQ96E09 287 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 RRN3Q9NYV6 651 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PLK2Q9NYY3 685 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.12■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 LRRC53A6NM62 1247 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CAPN9O14815 690 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ADAM23O75077 832 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 GRAP2O75791 330 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 12
BECN1-211ENST00000589636 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CXCR3P49682 368 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SGSHP51688 502 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CDK17Q00537 523 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 DMWDQ09019 674 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PPP2R5DQ14738 602 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 C5orf22Q49AR2 442 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TMEM215Q68D42 235 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SUMF1Q8NBK3 374 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 NUP58Q9BVL2 599 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TMEM51Q9NW97 253 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 EBF1Q9UH73 591 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.11■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PIEZO1Q92508 2521 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 FLT3P36888 993 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 DGKGP49619 791 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 NRLP54845 237 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 HGSNATQ68CP4 663 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 GRAMD4Q6IC98 578 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 MON1BQ7L1V2 547 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 RASSF3Q86WH2 238 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TSPY26PQ9H489 355 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.1■□□□□ 0.17
BECN1-211ENST00000589636 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms