RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTN4-211ENST00000589528 SLC12A8A0AV02 714 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 FAM149AA5PLN7 773 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 IKBKBO14920 756 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 FSBPO95073 299 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 YEATS4O95619 227 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 HLA-EP13747 358 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ABCG1P45844 678 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 GRIA4P48058 902 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 INCA1Q0VD86 236 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CUL4BQ13620 913 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CPXM2Q8N436 756 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF276Q8N554 614 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 IGSF8Q969P0 613 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 P2RY11Q96G91 374 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 DUSP16Q9BY84 665 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 DKK1O94907 266 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 SEMA4FO95754 770 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 DNTTP04053 509 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 NR3C1P04150 777 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ACSL1P33121 698 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 BCAT1P54687 386 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 SLC8A3P57103 927 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF394Q53GI3 561 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PLD4Q96BZ4 506 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 BACH2Q9BYV9 841 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 DMAC2Q9NW81 257 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 USP3Q9Y6I4 520 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 KCNK3O14649 394 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 HNF1BP35680 557 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 VAMP7P51809 220 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 C21orf59P57076 290 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.141e-6■□□□□ 9.4
ACTN4-211ENST00000589528 IL9RQ01113 521 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 MPPE1Q53F39 396 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 TMEM215Q68D42 235 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 DHRS13Q6UX07 377 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 LAYNQ6UX15 382 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF366Q8N895 744 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 GANCQ8TET4 914 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ARID3AQ99856 593 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 FBRSQ9HAH7 460 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 A0A087WV48 116 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PDXKO00764 312 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PCDHGA12O60330 932 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 DFNA5O60443 496 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 TSPAN3O60637 253 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 KRT13P13646 458 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CD27P26842 260 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ME1P48163 572 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 STK4Q13043 487 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CHST9Q7L1S5 443 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 SKA1Q96BD8 255 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 BIRC7Q96CA5 298 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PLXNA2O75051 1894 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 E9PAM4 449 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 H0Y8X5 98 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PLK4O00444 970 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 GCLMP48507 274 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF445P59923 1031 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 ZBTB16Q05516 673 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 CAMK2BQ13554 666 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 PTPRNQ16849 979 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTN4-211ENST00000589528 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms