RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1B0GTQ1 180 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPAN3O60637 253 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 EXOC3O60645 756 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 C1SP09871 688 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 PSEN1P49768 467 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 ASIC1P78348 528 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 EID2Q8N6I1 236 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-205ENST00000588780 CKAP5Q14008 2032 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 TGFB1I1O43294 461 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 SGK2Q9HBY8 427 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A087X0B3 334 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 STX6O43752 255 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ACTN2P35609 894 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RTP5Q14D33 572 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RABEP1Q15276 862 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM215Q68D42 235 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC6A18Q96N87 628 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 HHLA1C9JL84 531 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 VILLO15195 856 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 BRINP1O60477 761 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 AP3M2P53677 418 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB16Q05516 673 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 SCD5Q86SK9 330 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 UNC93AQ86WB7 457 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 LGMNQ99538 433 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 FBRSQ9HAH7 460 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 TENM4Q6N022 2769 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CFAP46Q8IYW2 2715 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC12A8A0AV02 714 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 NEFLP07196 543 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ACADVLP49748 655 aa22.79■■□□□ 1.24
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CAPNS1-205ENST00000588780 CHST9Q7L1S5 443 aa22.79■■□□□ 1.24
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CAPNS1-205ENST00000588780 ERVH48-1M5A8F1 160 aa22.78■■□□□ 1.24
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CAPNS1-205ENST00000588780 MPPE1Q53F39 396 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.78■■□□□ 1.24
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CAPNS1-205ENST00000588780 CPXM2Q8N436 756 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.78■■□□□ 1.24
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CAPNS1-205ENST00000588780 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 GDF3Q9NR23 364 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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CAPNS1-205ENST00000588780 GLDCP23378 1020 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNH2Q12809 1159 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 BROXQ5VW32 411 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM245Q9H330 911 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 CLMPQ9H6B4 373 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 UBE4BO95155 1302 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PPC4 97 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-205ENST00000588780 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-205ENST00000588780 YKT6O15498 198 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-205ENST00000588780 VNN1O95497 513 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-205ENST00000588780 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.76■■□□□ 1.23
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