RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RGS7P49802 495 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARID5AQ03989 594 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ENPP2Q13822 863 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 E2F5Q15329 346 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PPM1KQ8N3J5 372 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HDDC3Q8N4P3 179 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SORCS1Q8WY21 1168 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TFAP2BQ92481 460 aa29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PPP1R2P41236 205 aa29.46■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DAOAP59103 153 aa29.46■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PKDCCQ504Y2 493 aa29.46■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYCP2LQ5T4T6 812 aa29.46■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FOXJ1Q92949 421 aa29.46■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCDH15Q96QU1 1955 aa29.45■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIK3R2O00459 728 aa29.45■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MSI1O43347 362 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CETN1Q12798 172 aa29.45■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KAT5Q92993 513 aa29.45■■■□□ 2.31
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CACNA1EQ15878 2313 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 M0QYV0 167 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGAP33O14559 1287 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PMM2O15305 246 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EPHX1P07099 455 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRKCHP24723 683 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM215Q68D42 235 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMPRSS6Q8IU80 811 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCML4Q8N228 414 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MINDY1Q8N5J2 469 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SIPA1Q96FS4 1042 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SUSD2Q9UGT4 822 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CKAP5Q14008 2032 aa29.44■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TIMM44O43615 452 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OPHN1O60890 802 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYPP08247 313 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BRD2P25440 801 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF445P59923 1031 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SEMA3BQ13214 749 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLEKHG6Q3KR16 790 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR45BQ5MNZ6 344 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADGRF1Q5T601 910 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TTI2Q6NXR4 508 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PMF1Q6P1K2 205 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CACUL1Q86Y37 369 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2I1PQ8NGU4 316 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC35F5Q8WV83 523 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NELFBQ8WX92 580 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ITM2CQ9NQX7 267 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STOML2Q9UJZ1 356 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCNX2A6NKB5 2137 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MEI4A8MW99 385 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LATS1O95835 1130 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NCAM1P13591 858 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GNSP15586 552 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPINK2P20155 84 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAOBP27338 520 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNGA2Q16280 664 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZSWIM1Q9BR11 485 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPR174Q9BXC1 333 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CTNND2Q9UQB3 1225 aa29.42■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNJ18B7U540 433 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 P4HA2O15460 535 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GABBR2O75899 941 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CALCAP01258 141 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACADMP11310 421 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLA-FP30511 346 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TPMTP51580 245 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STILQ15468 1287 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MSANTD2Q6P1R3 559 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RRAGAQ7L523 313 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIP4P1Q86T03 277 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LMO3Q8TAP4 145 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IRGQQ8WZA9 623 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GOLGA1Q92805 767 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BICDL2A1A5D9 508 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UPK3BL1B0FP48 263 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UPK3BL2E5RIL1 263 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLA-EP13747 358 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BMP6P22004 513 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COPAP53621 1224 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLEC4CQ8WTT0 213 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCB8Q9NUT2 735 aa29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms