RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 BATF3Q9NR55 127 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EHD2Q9NZN4 543 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D29Q9UFV1 150 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 BAG5Q9UL15 447 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DENND2AQ9ULE3 1009 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CFL2Q9Y281 166 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GMEB1Q9Y692 573 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 WDR19Q8NEZ3 1342 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087X0M5 115 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GX30 115 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZAR1LA6NP61 321 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 F8W810 466 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 H0YIV9 168 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 M0R2C6 588 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HAT1O14929 419 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PRPSAP2O60256 369 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KERAO60938 352 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SEC22BO75396 215 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL2O95198 593 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 LARGE1O95461 756 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NPTXRO95502 500 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FESP07332 822 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CYP3A4P08684 503 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 POU2F2P09086 479 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAR1AP10644 381 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HSPA6P17066 643 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ALOX12P18054 663 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RHCEP18577 417 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 S100A1P23297 94 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CNTFP26441 200 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 LIFRP42702 1097 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SCNN1GP51170 649 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CARD18P57730 90 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TPM4P67936 248 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NOP14P78316 857 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GSTO1P78417 241 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMPRSS15P98073 1019 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TFAP4Q01664 338 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RHDQ02161 417 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HSPA14Q0VDF9 509 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TFCP2Q12800 502 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 COTL1Q14019 142 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT3Q14435 633 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 STAT4Q14765 748 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NCF4Q15080 339 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ABCB5Q2M3G0 1257 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC153Q494R4 210 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 XKR3Q5GH77 459 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 COLEC12Q5KU26 742 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 LBX2Q6XYB7 198 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SPATC1Q76KD6 591 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DPP9Q86TI2 863 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FAM178BQ8IXR5 827 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PRR18Q8N4B5 295 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ARL14Q8N4G2 192 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC63Q8NA47 563 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GPT2Q8TD30 523 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HERVK_113Q902F9 699 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RUBCNQ92622 972 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 LENG9Q96B70 501 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf60Q96EN9 201 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM176AQ96HP8 235 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms