RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SMARCD2Q92925 531 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 PLD4Q96BZ4 506 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 KXD1Q9BQD3 176 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 RNF38Q9H0F5 515 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 WDCPQ9H6R7 721 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 KCNK12Q9HB15 430 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 AMFRQ9UKV5 643 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 USP18Q9UMW8 372 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC66A2RUB6 948 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ESPNB1AK53 854 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 PSTPIP1O43586 416 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ECI2O75521 394 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 IGLV3-27P01718 113 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 APOEP02649 317 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 HMBSP08397 361 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 KRT7P08729 469 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 IRF1P10914 325 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TNNT1P13805 278 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TCF4P15884 667 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 WEE1P30291 646 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 GJC1P36383 396 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 AIF1P55008 147 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 MTA1Q13330 715 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TDGQ13569 410 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 GRM2Q14416 872 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 PPP2R5DQ14738 602 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 RAB6CQ53S08 254 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 BOLA3Q53S33 107 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 EFHC2Q5JST6 749 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 LRRC38Q5VT99 294 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 VITQ6UXI7 678 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SLC35F6Q8N357 371 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TTC16Q8NEE8 873 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 RIN3Q8TB24 985 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 NXPE3Q969Y0 559 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 NTAN1Q96AB6 310 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SLC39A13Q96H72 371 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ZWILCHQ9H900 591 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TDP1Q9NUW8 608 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CCL26Q9Y258 94 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CPQQ9Y646 472 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 COL4A2P08572 1712 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 CTAGE9A4FU28 777 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 TNFRSF10AO00220 468 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 LEFTY2O00292 366 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF8-210ENST00000574217 ENC1O14682 589 aa6.94□□□□□ -1.3
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