RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 DERAQ9Y315 318 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 BEST1O76090 585 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 NR2C2P49116 596 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SESN3P58005 492 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 OCRLQ01968 901 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADIGQ0VDE8 80 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 AP1B1Q10567 949 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF11Q15544 211 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOTUMQ6P988 496 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 OLFM3Q96PB7 478 aa20.62■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIRO00625 290 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 NDUFV1P49821 464 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SULT1E1P49888 294 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCNG1P51959 295 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DGKDQ16760 1214 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF6Q58WW2 860 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CES3Q6UWW8 571 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 STKLD1Q8NE28 680 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM167BQ9BTA0 163 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSAT1Q9Y617 370 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DGKIO75912 1065 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MGAT1P26572 445 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 AQP5P55064 265 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX16P57768 344 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCNA1P78396 465 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 RFX8Q6ZV50 586 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIGZQ86VD9 579 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 C7orf26Q96N11 449 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX25Q9H3E2 840 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.61■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A0A0MRY4 1105 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF487B1APH4 448 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CREB3O43889 395 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL1BP01584 269 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA13Q96N96 652 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 FZD10Q9ULW2 581 aa20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 E2F8A0AVK6 867 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 BPGMP07738 259 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRHR1P34998 444 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARL4AP40617 200 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 OSTM1Q86WC4 334 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MIEF2Q96C03 454 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTBPQ96DY7 904 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 P2RY11Q96G91 374 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAML3Q96JK9 1138 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 EBF4Q9BQW3 602 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 BTBD19C9JJ37 291 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF103O00237 685 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GSRP00390 522 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSMB4P28070 264 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 MATKP42679 507 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERFP50548 548 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 RCN2Q14257 317 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATG16L1Q676U5 607 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCNYQ8ND76 341 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRCA2P51587 3418 aa20.59■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT36O76013 467 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GSTA2P09210 222 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP2C9P11712 490 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABL2P42684 1182 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms