RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 NAT1P18440 290 aa7.55□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.55□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 AOC1P19801 751 aa7.54□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 NAB2Q15742 525 aa7.54□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PSMD5Q16401 504 aa7.54□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 USP41Q3LFD5 358 aa7.54□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.54□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC51Q96ER9 411 aa7.54□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.54□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.54□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.54□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 GDF5P43026 501 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 BRCC3P46736 316 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CLCNKBP51801 687 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 HTR4Q13639 388 aa7.53□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TTC38Q5R3I4 469 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PARM1Q6UWI2 310 aa7.53□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 HACE1Q8IYU2 909 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 DEPTORQ8TB45 409 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 ITFG1Q8TB96 612 aa7.53□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 C8orf76Q96K31 380 aa7.53□□□□□ -1.2
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GNPTAB-209ENST00000552009 KXD1Q9BQD3 176 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 FZD8Q9H461 694 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CD248Q9HCU0 757 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 KCND1Q9NSA2 647 aa7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.2
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC169A6NNP5 214 aa7.52□□□□□ -1.21
GNPTAB-209ENST00000552009 GSTA4O15217 222 aa7.52□□□□□ -1.21
GNPTAB-209ENST00000552009 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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