RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 RRADP55042 308 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 RPS8P62241 208 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MECOMQ03112 1051 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 C2orf54Q08AI8 447 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 BIRC3Q13489 604 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CUL1Q13616 776 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PLS1Q14651 629 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 RTP5Q14D33 572 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PLCB4Q15147 1175 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 IL17AQ16552 155 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CALCRLQ16602 461 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 TXNRD1Q16881 649 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 LETM2Q2VYF4 491 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 FAM47AQ5JRC9 791 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 C12orf60Q5U649 245 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PDXDC1Q6P996 788 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KDM7AQ6ZMT4 941 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 RRAGAQ7L523 313 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 DPP9Q86TI2 863 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MYOCDQ8IZQ8 938 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CPXCR1Q8N123 301 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KRT78Q8N1N4 520 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 OR7D4Q8NG98 312 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 STON2Q8WXE9 905 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 APIPQ96GX9 242 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KCNC2Q96PR1 638 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MXD3Q9BW11 206 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 BCO1Q9HAY6 547 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KCNK12Q9HB15 430 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 NCDNQ9UBB6 729 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 STX8Q9UNK0 236 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 LZTS1Q9Y250 596 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 ABCA3Q99758 1704 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 A0A1B0GUL6 1792 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KAT6BQ8WYB5 2073 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CACNA1SQ13698 1873 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PHLPP1O60346 1717 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 A0A0U1RQJ8 604 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 RASA4BC9J798 803 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KLRF2D3W0D1 207 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CETN3O15182 167 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 RASA4O43374 803 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 SRGAP2O75044 1071 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 SEMA7AO75326 666 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 GPR32O75388 356 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 FLOT1O75955 427 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 GFPT2O94808 682 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MOCS3O95396 460 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MYZAPP0CAP1 466 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 TYRP14679 529 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 BRAFP15056 766 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 NR1D1P20393 614 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 DDCP20711 480 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MALP21145 153 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 TECP42680 631 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 ETV4P43268 484 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CCT5P48643 541 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 PRIM2P49643 509 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 ADCY7P51828 1080 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 CREMQ03060 361 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 DUSP2Q05923 314 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 STK4Q13043 487 aa4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
USP25-210ENST00000549362 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms