RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-210	ENST00000549306	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	COL15A1	P39059	1388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	EEA1	Q15075	1411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PRY	O14603	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	WDR47	O94967	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	RHCE	P18577	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	DUSP1	P28562	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	NEK2	P51955	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	GAD2	Q05329	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	EME1	Q96AY2	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	LDB3	O75112	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	BRAF	P15056	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	DGKQ	P52824	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	MTAP	Q13126	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	CDT1	Q9H211	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	HTR7	P34969	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	GJA10	Q969M2	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	CUX1	P39880	1505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	TUSC2	O75896	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	IFNA2	P01563	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	AKR1A1	P14550	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	CPA1	P15085	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	GAB1	Q13480	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	PGM5	Q15124	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	SOCS5	O75159	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	NDUFS1	P28331	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HECTD4-210	ENST00000549306	CIITA	P33076	1130 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms