RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549007.1

APAF1-208, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 3,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APAF1-208	ENST00000549007	IL1R2	P27930	398 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	ETV4	P43268	484 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	BACE1	P56817	501 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	PPAT	Q06203	517 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	KLRC3	Q07444	240 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	PDCL	Q13371	301 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	WTAP	Q15007	396 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	HTRA1	Q92743	480 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	COG8	Q96MW5	612 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.15	□□□□□ -1.74
APAF1-208	ENST00000549007	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	HYI	Q5T013	277 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	ERICH2	A1L162	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PDHX	O00330	501 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	SLC1A4	P43007	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	KRT32	Q14532	448 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.15	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	FLOT1	O75955	427 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	RASAL1	O95294	804 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	CETP	P11597	493 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	MAN1A1	P33908	653 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	ARL4C	P56559	192 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	CXCL11	O14625	94 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	ACTL6B	O94805	426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	PDHB	P11177	359 aa		4.14	□□□□□ -1.75
APAF1-208	ENST00000549007	MST1	P26927	711 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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