RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 H3BNH8 94 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 H7C0C1 242 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TRPA1O75762 1119 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 KRT3P12035 628 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TPSB2P20231 275 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TGM2P21980 687 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PCSK6P29122 969 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ATP5OP48047 213 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 LIG4P49917 911 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TPSAB1Q15661 275 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZBED5Q49AG3 693 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C16orf46Q6P387 395 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SLC35B4Q969S0 331 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZNF597Q96LX8 424 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 IDI2Q9BXS1 227 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 HIPK3Q9H422 1215 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PDZD7Q9H5P4 517 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C8orf4Q9NR00 106 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CYB561D2O14569 222 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ADCY6O43306 1168 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 LRCH4O75427 683 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 STAMBPO95630 424 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RALBP11234 206 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TCF4P15884 667 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NUDT2P50583 147 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 RELAQ04206 551 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 GRM1Q13255 1194 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 EPGNQ6UW88 154 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ILDR2Q71H61 639 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 C17orf50Q8WW18 174 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 EME1Q96AY2 570 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 NAT9Q9BTE0 207 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CDH19Q9H159 772 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SDCBP2Q9H190 292 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SEPT3Q9UH03 358 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TMEM247A6NEH6 219 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 DCXO43602 365 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 TADA2AO75478 443 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 SERPINB7O75635 380 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PIAS1O75925 651 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 CALCAP01258 141 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 APOA4P06727 396 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 OCM2P0CE71 109 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MLNP12872 115 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 HSD17B4P51659 736 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 OGDHQ02218 1023 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB17Q13105 803 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PPIL2Q13356 520 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 BMPR2Q13873 1038 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PDK2Q15119 407 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 PIGGQ5H8A4 983 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-215ENST00000537304 MROH9Q5TGP6 573 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms