RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CREB1P16220 341 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.051e-5■■■■□ 24.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DENND2CQ68D51 928 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VPS50Q96JG6 964 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KLK15Q9H2R5 256 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ASB6Q9NWX5 421 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CA14Q9ULX7 337 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CEP350Q5VT06 3117 aa8.51□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A087WV62 115 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GPD1P21695 349 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ITPKBP27987 946 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATP1A4Q13733 1029 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CEP85Q6P2H3 762 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF527Q8NB42 609 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C18orf8Q96DM3 657 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CRB3Q9BUF7 120 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KIF1BO60333 1816 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TECPR2O15040 1411 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VIPP01282 170 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HTR7P34969 479 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SARAFQ96BY9 339 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SNX15Q9NRS6 342 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MYOM1P52179 1685 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR2W5A6NFC9 320 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPRY2O43597 315 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMPRSS11DO60235 418 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NUDT3O95989 172 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.059e-6■■■□□ 17.7
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM225BP0DP42 221 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BMP5P22003 454 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 POF1BQ8WVV4 589 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WDR47O94967 919 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GLP2RO95838 553 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FGAP02671 866 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ICA1Q05084 483 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ACOX1Q15067 660 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WDR24Q96S15 920 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SYT17Q9BSW7 474 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DLC1Q96QB1 1528 aa8.46□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 JTBO76095 146 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PDE8BO95263 885 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ADRA1DP25100 572 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FHL3Q13643 280 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRT72Q14CN4 511 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TTC30AQ86WT1 665 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ABCC11Q96J66 1382 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IFT172Q9UG01 1749 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CASZ1Q86V15 1759 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF213O14771 459 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PIP5K1BO14986 540 aa8.45□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FPR3P25089 353 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms