RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528470.5

RRM1-206, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 3

Gene RRM1, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-206	ENST00000528470	PCDH17	O14917	1159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SEPT4	O43236	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PPP6R2	O75170	966 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	VPS4B	O75351	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	VDR	P11473	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SPINK2	P20155	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SLC6A4	P31645	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MAP2K2	P36507	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	STAT1	P42224	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	EPS15	P42566	896 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	NPTX2	P47972	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CCR9	P51686	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SEC24C	P53992	1094 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TERF1	P54274	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	DUSP8	Q13202	625 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CSHL1	Q14406	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PSMD6	Q15008	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MEA1	Q16626	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TTC14	Q96N46	770 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	RTL9	Q8NET4	1388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	IL16	Q14005	1332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	FOXN1	O15353	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CA12	O43570	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PEX10	O60683	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	LARGE1	O95461	756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PROC	P04070	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CPA1	P15085	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ZNF28	P17035	718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	FDXR	P22570	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MGAT1	P26572	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	KLRK1	P26718	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ARL3	P36405	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	MMP14	P50281	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	DLG4	P78352	724 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TCF15	Q12870	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	CUL4A	Q13619	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	BAK1	Q16611	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRM1-206	ENST00000528470	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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