RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF34Q969K3 372 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 HAPLN3Q96S86 360 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 PEBP4Q96S96 227 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 CCL26Q9Y258 94 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 I6L893 689 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 Q6ZNB5 142 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 E2F7Q96AV8 911 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 HES6Q96HZ4 224 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 COL6A3P12111 3177 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 E2F8A0AVK6 867 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC66A2RUB6 948 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 LEFTY2O00292 366 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 FTCDO95954 541 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 KLKB1P03952 638 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 CTNNA2P26232 953 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 USP4Q13107 963 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF77Q15935 545 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC185Q8N715 623 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 FZD10Q9ULW2 581 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM50BQ9Y247 325 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-205ENST00000528462 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 GNG11P61952 73 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf74Q96LT6 269 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 TUBB4AP04350 444 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 HMBSP08397 361 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 RARAP10276 462 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 FCARP24071 287 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC11A2P49281 568 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 EFHC2Q5JST6 749 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC35F6Q8N357 371 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 PAGE1O75459 146 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 PEX5P50542 639 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 DPYSL2Q16555 572 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM71BQ8TC56 605 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 WBP2Q969T9 261 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 TLR10Q9BXR5 811 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ACSL4O60488 711 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ADGRF1Q5T601 910 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 DENND1CQ8IV53 801 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 RIN3Q8TB24 985 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT35Q92764 455 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR24Q96S15 920 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ZWILCHQ9H900 591 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 NR2E1Q9Y466 385 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 IRF1P10914 325 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA3BQ13214 749 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS6KA1Q15418 735 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 MTSS1LQ765P7 747 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 VSIG1Q86XK7 387 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 OTUB2Q96DC9 234 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-205ENST00000528462 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
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