RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526865.5

RRM1-204, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 4

Gene RRM1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-204	ENST00000526865	MYL1	P05976	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ADRB2	P07550	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HLA-E	P13747	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	VIPR2	P41587	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CCR10	P46092	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CASP4	P49662	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TAF6	P49848	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	UCN	P55089	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DUSP4	Q13115	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PLD1	Q13393	1074 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ADAM9	Q13443	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	BIRC3	Q13489	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TRPC3	Q13507	836 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DMC1	Q14565	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TAF12	Q16514	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CAMK4	Q16566	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	KCNN1	Q92952	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CDC6	Q99741	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	LAMA5	O15230	3695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HMX2	A2RU54	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865		M0QZQ0	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PDXK	O00764	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	DCLK1	O15075	740 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	AP5Z1	O43299	807 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ABLIM3	O94929	683 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	KIF20A	O95235	890 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	NR3C1	P04150	777 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CDK4	P11802	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ODC1	P11926	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MYL4	P12829	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CD59	P13987	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ATF2	P15336	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	GJA1	P17302	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	HNF1B	P35680	557 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PNPLA4	P41247	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PRCP	P42785	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SOX9	P48436	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	EPHB3	P54753	998 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MYL6	P60660	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	FAM193A	P78312	1265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	ROR1	Q01973	937 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	EHHADH	Q08426	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	TWF1	Q12792	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	PSMD6	Q15008	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SURF1	Q15526	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SV2C	Q496J9	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRM1-204	ENST00000526865	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms