RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523160.1

STAU2-223, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene STAU2, Length 227 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-223	ENST00000523160	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	KLHL41	O60662	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SLC43A1	O75387	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PDHA1	P08559	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	C1S	P09871	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SELL	P14151	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	COX7A2	P14406	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	IL4R	P24394	825 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	MCM3	P25205	808 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PCSK1	P29120	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ICAM3	P32942	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SLC15A1	P46059	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ZNF81	P51508	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ARFIP1	P53367	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	OLR1	P78380	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ADAM17	P78536	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CD69	Q07108	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	LMAN2	Q12907	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PDCL	Q13371	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ALCAM	Q13740	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	STIL	Q15468	1287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CHSY3	Q70JA7	882 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	URAD	A6NGE7	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CCDC188	H7C350	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160		H7C4K7	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SMPD2	O60906	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TAF5L	O75529	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	C22orf31	O95567	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	RB1	P06400	928 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CYP21A2	P08686	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SRC	P12931	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	ALAD	P13716	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PNLIP	P16233	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	SULT1E1	P49888	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	NPY4R	P50391	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	CLCN7	P51798	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	STAT2	P52630	851 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	STX1B	P61266	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TEF	Q10587	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	KCNMA1	Q12791	1236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TCF15	Q12870	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	RALGDS	Q12967	914 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	TUBB3	Q13509	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-223	ENST00000523160	GAS6	Q14393	721 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms