RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM170AA1A519 330 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ATG13O75143 517 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF40O75150 1001 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 GRAP2O75791 330 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 LATS1O95835 1130 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 APOEP02649 317 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FYNP06241 537 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TYRP14679 529 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 GBP1P32455 592 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 CNR2P34972 360 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC6A11P48066 632 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC11A2P49281 568 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FMO1Q01740 532 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 KDSRQ06136 332 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 RING1Q06587 406 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 NNTQ13423 1086 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TAF5Q15542 800 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 GAB4Q2WGN9 574 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TAC4Q86UU9 113 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 DEFB106AQ8N104 65 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 CPXM2Q8N436 756 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAM32Q8TC27 787 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 MARK1Q9P0L2 795 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 IFNKQ9P0W0 207 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRC53A6NM62 1247 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 CBFA2T2O43439 604 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TULP3O75386 442 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 DAB1O75553 588 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 KAT7O95251 611 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 CHRNB2P17787 502 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 HOXC13P31276 330 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 GRIA2P42262 883 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 GABRB2P47870 512 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF445P59923 1031 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ASIC2Q16515 512 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 GRAMD4Q6IC98 578 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 C12orf40Q86WS4 652 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF214Q8ND24 703 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 DDI1Q8WTU0 396 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 BHMTQ93088 406 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF34Q969K3 372 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 AGPAT1Q99943 283 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 IRAK2O43187 625 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 CACNG3O60359 315 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 IGLV3-27P01718 113 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TNFAIP3P21580 790 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 NOS2P35228 1153 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SCNN1AP37088 669 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 PXNP49023 591 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 MPPE1Q53F39 396 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FIGNQ5HY92 759 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRF1Q5T601 910 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 NETO1Q8TDF5 533 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 BAP1Q92560 729 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ACDQ96AP0 544 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 IQCDQ96DY2 449 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 DDIT4Q9NX09 232 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 RRN3Q9NYV6 651 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 PLK2Q9NYY3 685 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.161e-9■■■■■ 42.1
TSNARE1-206ENST00000520462 COX16Q9P0S2 106 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ACSL4O60488 711 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPAN3O60637 253 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 LRP3O75074 770 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC2A3P11169 496 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNA4P22459 653 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 MATKP42679 507 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 DGKGP49619 791 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SEC13P55735 322 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms