RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	PBX1	P40424	430 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CFHR3	Q02985	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	KCNJ12	Q14500	433 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TAF3	Q5VWG9	929 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CHSY1	Q86X52	802 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	RITA1	Q96K30	269 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	ASIC5	Q9NY37	505 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CDC23	Q9UJX2	597 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TISP43	B9A030	160 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	PRRT4	C9JH25	899 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331		H3BNC9	293 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CA12	O43570	354 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CBFA2T3	O75081	653 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	DRD1	P21728	446 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	GSTM5	P46439	218 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	DNASE1L3	Q13609	305 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM51	Q9NW97	253 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	FFAR2	O15552	330 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MMP8	P22894	467 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CERS1	P27544	350 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TERF1	P54274	439 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	C21orf58	P58505	322 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	RHBDL3	P58872	404 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	GPC5	P78333	572 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TNFAIP2	Q03169	654 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	DMTN	Q08495	405 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	SEMA3B	Q13214	749 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MORC3	Q14149	939 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	KCNB1	Q14721	858 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	P3H1	Q32P28	736 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF527	Q8NB42	609 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	DPF1	Q92782	380 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	C18orf8	Q96DM3	657 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	SLC39A13	Q96H72	371 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	VPS45	Q9NRW7	570 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	FZD4	Q9ULV1	537 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	WIPF3	A6NGB9	483 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	PIP5K1B	O14986	540 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	MMP14	P50281	582 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	KRTAP10-9	P60411	292 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	BFSP2	Q13515	415 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CSHL1	Q14406	222 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	SKAP1	Q86WV1	359 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GFM2-208	ENST00000513331	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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