RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	GINS2	Q9Y248	185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	NCKAP5	O14513	1909 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	RAD51B	O15315	384 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	LATS1	O95835	1130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	FTH1	P02794	183 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ALDH2	P05091	517 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	MSH3	P20585	1137 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	GSTM2	P28161	218 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	CDH17	Q12864	832 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SPDL1	Q96EA4	605 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	GTF3C1	Q12789	2109 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	MPZL2	O60487	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PRDM1	O75626	825 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ADH1A	P07327	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	NR4A1	P22736	598 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ACTR3	P61158	418 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DLG1	Q12959	904 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467		M0QYV0	167 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PALM	O75781	387 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	RAD17	O75943	681 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	IGSF6	O95976	241 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	NOS2	P35228	1153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PTPN7	P35236	360 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	MTMR2	Q13614	643 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	KIF19	Q2TAC6	998 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DPP3	Q9NY33	737 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	B4GALT4	O60513	344 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	LRRN2	O75325	713 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ST3GAL1	Q11201	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	MREG	Q8N565	214 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	RNF149	Q8NC42	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	CEP19	Q96LK0	163 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF711	Q9Y462	761 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	TTC36	A6NLP5	189 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	KRT75	O95678	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	NPPA	P01160	153 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	FGF1	P05230	155 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SHMT1	P34896	483 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC26A3	P40879	764 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	PTEN	P60484	403 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	SFR1	Q86XK3	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN13-209	ENST00000511467	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6

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