RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PLXNA3P51805 1871 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM120BA0PK00 339 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 C5orf60A6NFR6 353 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 BDNFP23560 247 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SSTR1P30872 391 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ADRA1BP35368 520 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DSC1Q08554 894 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NME3Q13232 169 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 BBS9Q3SYG4 887 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TOX2Q96NM4 488 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 COX16Q9P0S2 106 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD11O43934 449 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 B4GALT3O60512 393 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NCAM1P13591 858 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 BRAFP15056 766 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TSPY1Q01534 308 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SEMA3BQ13214 749 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DPYSQ14117 519 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMED2Q15363 201 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TRABD2AQ86V40 505 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PALM2Q8IXS6 379 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DPF3Q92784 378 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM209Q96SK2 561 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TET1Q8NFU7 2136 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RASA4BC9J798 803 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 F8W810 466 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RASA4O43374 803 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CREB3O43889 395 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DDHD2O94830 711 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 F9P00740 461 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TPSB2P20231 275 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ELK3P41970 407 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TPSAB1Q15661 275 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 BEND5Q7L4P6 421 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SRLQ86TD4 932 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HOMEZQ8IX15 550 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MCUQ8NE86 351 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FBF1Q8TES7 1133 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SENP1Q9P0U3 644 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 GGA2Q9UJY4 613 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 I6L893 689 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DCLK1O15075 740 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SPAG6O75602 509 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 METTL18O95568 372 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 VAV1P15498 845 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DRD4P21917 467 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HCAR3P49019 387 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 GLUD2P49448 558 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CXCR3P49682 368 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FAAP100Q0VG06 881 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FAXCQ5TGI0 409 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RFX8Q6ZV50 586 aa8.46□□□□□ -1.05
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