RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RFKQ969G6 155 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NLRP4Q96MN2 994 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SLC30A3Q99726 388 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 UCK1Q9HA47 277 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CENPMQ9NSP4 180 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 EHD2Q9NZN4 543 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 VAV3Q9UKW4 847 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SPACA6W5XKT8 324 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MYPNQ86TC9 1320 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GUA9 196 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ERICH2A1L162 156 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 H7C1D1 291 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DVL2O14641 736 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZW10O43264 779 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TGM5O43548 720 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 OR5F1O95221 314 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CYP3A4P08684 503 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RARGP13631 454 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CHMLP26374 656 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 LTKP29376 864 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TM4SF1P30408 202 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 OR1G1P47890 313 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 FNTAP49354 379 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 STARP49675 285 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RAC3P60763 192 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP8P85298 464 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 FMO1Q01740 532 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 GALNT2Q10471 571 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 STIM1Q13586 685 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZMYND11Q15326 602 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RAB30Q15771 203 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NTRK3Q16288 839 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RASIP1Q5U651 963 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ATL3Q6DD88 541 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 STYXQ8WUJ0 223 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 PEX13Q92968 403 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PHF21BQ96EK2 531 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HHIPQ96QV1 700 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 USP28Q96RU2 1077 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PINK1Q9BXM7 581 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 CBX8Q9HC52 389 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NUDT15Q9NV35 164 aa7.54□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DSEQ9UL01 958 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SNX6Q9UNH7 406 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.54□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.53□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PQ09 198 aa7.53□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 C5orf51A6NDU8 294 aa7.53□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TARM1B6A8C7 271 aa7.53□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MEIS2O14770 477 aa7.53□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SLC16A6O15403 523 aa7.53□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 KRT86O43790 486 aa7.53□□□□□ -1.2
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