RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 B4GALNT1Q00973 533 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 MTA1Q13330 715 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ELF2Q15723 593 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ACSM6Q6P461 480 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FAM57BQ71RH2 274 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 OR2C3Q8N628 320 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 GLMPQ8WWB7 406 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PMM1Q92871 262 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 GJA10Q969M2 543 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 POT1Q9NUX5 634 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CA14Q9ULX7 337 aa3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 DHHO43323 396 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PRC1O43663 620 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CAND2O75155 1236 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TFEBP19484 476 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 SLC8A1P32418 973 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 AGTR2P50052 363 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ZNF84P51523 738 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 MTX1Q13505 466 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 LONRF1Q17RB8 773 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 P3H1Q32P28 736 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 MAP9Q49MG5 647 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 IL31Q6EBC2 164 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TTC30AQ86WT1 665 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 RFX6Q8HWS3 928 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 LAS2Q8IYD9 372 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ASB12Q8WXK4 309 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ZNF566Q969W8 418 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 RIPOR3Q96MK2 946 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 WACQ9BTA9 647 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PCGF6Q9BYE7 350 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CHST12Q9NRB3 414 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FNIP2Q9P278 1114 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CEP83Q9Y592 693 aa3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 F8W810 466 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 M0QZQ0 153 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PODXLO00592 558 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 NPC1O15118 1278 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 INSIG1O15503 277 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TULP3O75386 442 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 SGPL1O95470 568 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ALADP13716 330 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ST6GAL1P15907 406 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 SCP2P22307 547 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 STAT6P42226 847 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 SOX2P48431 317 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 NEK3P51956 506 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 AK2P54819 239 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 FHL1Q13642 323 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CBFBQ13951 182 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CSHL1Q14406 222 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CCDC181Q5TID7 509 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PIM3Q86V86 326 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 MMP21Q8N119 569 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 NSMCE1Q8WV22 266 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 KAT2BQ92831 832 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 CCDC138Q96M89 665 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 TRIM2Q9C040 744 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.68□□□□□ -1.82
CMC1-211ENST00000495428 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms