RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP3A5	P20815	502 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRPAP1	P30533	357 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT9	P35527	623 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL6	P41182	706 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAP1GAP	P47736	663 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDH8	P55286	799 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GUCY1A3	Q02108	690 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DSC1	Q08554	894 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR3DS1	Q14943	382 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEA1	Q16626	185 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM240	Q5SV17	173 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF365	Q70YC5	407 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSTM1	Q86WC4	334 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PALB2	Q86YC2	1186 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	JAML	Q86YT9	394 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHC3	Q92529	594 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEPT8	Q92599	483 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TWNK	Q96RR1	684 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FNBP1	Q96RU3	617 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSAD1	Q9HA92	442 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GULP1	Q9UBP9	304 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NENF	Q9UMX5	172 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DERA	Q9Y315	318 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2CD2	Q9Y426	696 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCN5A	Q14524	2016 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM170A	A1A519	330 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266		F8VZ95	297 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266		I3L4J1	428 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CKM	P06732	381 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	WEE2	P0C1S8	567 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPN2	P17655	700 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGFALS	P35858	605 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PBX3	P40426	434 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIK3CA	P42336	1068 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRCC3	P46736	316 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36	5e-8	■■□□□ 13.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB27A	P51159	221 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLCNKB	P51801	687 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF132	P52740	706 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBED6	P86452	979 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	BIRC3	Q13489	604 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF460	Q14592	562 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC14A2	Q15849	920 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KYAT1	Q16773	422 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD302	Q8IX05	232 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFAP2B	Q92481	460 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK33	Q9BYT3	514 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CWH43	Q9H720	699 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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