RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489614.5

NOD1-208, Transcript of nucleotide binding oligomerization domain containing 1, human

TSL 2

Gene NOD1, Length 3,098 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOD1-208	ENST00000489614	AMPD1	P23109	780 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	MTFR1	Q15390	333 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	MATN2	O00339	956 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	BIRC5	O15392	142 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	RECQL4	O94761	1208 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PTPN4	P29074	926 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	MED21	Q13503	144 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	GYG2	O15488	501 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	HAUS5	O94927	633 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CXCL10	P02778	98 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	VPS51	Q9UID3	782 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614		E9PBE3	544 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ZBED1	O96006	694 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	BRAF	P15056	766 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CDC16	Q13042	620 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TGFBI	Q15582	683 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614		Q6ZNX1	250 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	NUP93	Q8N1F7	819 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	BBS5	Q8N3I7	341 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PITPNM1	O00562	1244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	GPR182	O15218	404 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CYP26A1	O43174	497 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CILP	O75339	1184 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	DGKI	O75912	1065 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TPPP	O94811	219 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TNNC2	P02585	160 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	FOXN2	P32314	431 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CENPC	Q03188	943 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NOD1-208	ENST00000489614		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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