RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488632.1

LBR-208, Transcript of lamin B receptor, human

TSL 3

Gene LBR, Length 425 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LBR-208	ENST00000488632	PHF2	O75151	1096 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MED24	O75448	989 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ENDOD1	O94919	500 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	FSBP	O95073	299 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	KIF20A	O95235	890 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GGPS1	O95749	300 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GH1	P01241	217 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	TPM3	P06753	285 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	C8B	P07358	591 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	PLA2G4B	P0C869	781 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	TGFB3	P10600	412 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	IDE	P14735	1019 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	KCNA2	P16389	499 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GAP43	P17677	238 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	EDNRB	P24530	442 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	HTR1B	P28222	390 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	CASP1	P29466	404 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ICAM3	P32942	547 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	THBS2	P35442	1172 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	TM4SF4	P48230	202 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ACTR2	P61160	394 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	PSMC5	P62195	406 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MYL5	Q02045	173 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	PRKCE	Q02156	737 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SP4	Q02446	784 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	COASY	Q13057	564 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SEMA5A	Q13591	1074 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	CUL4B	Q13620	913 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	NEDD9	Q14511	834 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	KCNB1	Q14721	858 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	KIF22	Q14807	665 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ARHGEF6	Q15052	776 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	CR1L	Q2VPA4	569 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	RNF220	Q5VTB9	566 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	C17orf99	Q6UX52	265 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	METTL7B	Q6UX53	244 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	UNC13D	Q70J99	1090 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ARMCX2	Q7L311	632 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	EMSY	Q7Z589	1322 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GPR142	Q7Z601	462 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	STK32C	Q86UX6	486 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	PROSER1	Q86XN7	944 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	KRT78	Q8N1N4	520 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	DTX3	Q8N9I9	347 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MLKL	Q8NB16	471 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GPR156	Q8NFN8	814 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	NRG4	Q8WWG1	115 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	STAM	Q92783	540 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	PGBD4	Q96DM1	585 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	C8orf49	Q96NF6	230 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	GSDMA	Q96QA5	445 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	TSG101	Q99816	390 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	TRIM9	Q9C026	710 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		2.55	□□□□□ -2
LBR-208	ENST00000488632	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		2.55	□□□□□ -2

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