RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPASTQ9UBP0 616 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS28Q9UK41 221 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BDNFP23560 247 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF470Q6ECI4 717 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUFUQ9UMX1 484 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V1G2O95670 118 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WEE1P30291 646 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCGRTP55899 365 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDPK2PQ6A1A2 396 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIER2Q8N344 545 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CATSPER2Q96P56 530 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBP50607 506 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC9A9Q8IVB4 645 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF555Q8NEP9 628 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HES6Q96HZ4 224 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF333Q96JL9 665 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SALL4Q9UJQ4 1053 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCXO43602 365 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS26AO75436 327 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLT3P36888 993 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAS2R40P59535 323 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EML3Q32P44 896 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF786Q8N393 782 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARNMT1Q8N4J0 409 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf29Q8N999 325 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDT1Q9H211 546 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5orf58C9J3I9 102 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NR5A2O00482 541 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE5AO76074 875 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAIAP3O94812 1187 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.315e-7■■■■□ 21.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVK-10P10266 1014 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OXCT1P55809 520 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT72Q14CN4 511 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP4R4Q6NUP7 873 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IZUMO2Q6UXV1 221 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PALB2Q86YC2 1186 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDI1Q8WTU0 396 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VAV3Q9UKW4 847 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNHG28P0DPA3 235 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGB6P18564 788 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RANBP1P43487 201 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDAC4P56524 1084 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DSG1Q02413 1049 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNMB4Q86W47 210 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOPT1Q96IL0 206 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EVPLLA8MZ36 301 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS3O15072 1205 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL22P35268 128 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC1A6P48664 564 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH17Q12864 832 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ISLR2Q6UXK2 745 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACADSP16219 412 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKN3Q6P5Z2 889 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf96Q7Z7L8 435 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNPY4Q8N129 248 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYLK2Q9H1R3 596 aa17■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NID2Q14112 1375 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX10O60683 326 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G6O60733 806 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP1A2P05177 515 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF23P17027 643 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIPK3Q9Y572 518 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STRNO43815 780 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM13O60858 407 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOMO3P69849 1222 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HGSNATQ68CP4 663 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUPD1Q68J44 220 aa16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms