RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481655.2

CTCFL-210, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-210ENST00000481655 CDH7Q9ULB5 785 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 FZD10Q9ULW2 581 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ZNF510Q9Y2H8 683 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 LATS1O95835 1130 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 KRT1P04264 644 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 RARAP10276 462 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 TCF4P15884 667 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 KCNA5P22460 613 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PDK2Q15119 407 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CLUL1Q15846 466 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 EXD1Q8NHP7 514 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 KRT35Q92764 455 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 AZIN2Q96A70 460 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PBKQ96KB5 322 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PEBP4Q96S96 227 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CARD9Q9H257 536 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 SNX12Q9UMY4 172 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 LRRD1A4D1F6 860 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 STC2O76061 302 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 IRF1P10914 325 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ARL4AP40617 200 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PEX5P50542 639 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 KCNQ1P51787 676 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 DPYSL2Q16555 572 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 RAB6CQ53S08 254 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PPM1EQ8WY54 764 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 SMARCD2Q92925 531 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 HLA-CQ95604 372 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 EPAS1Q99814 870 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 GKN1Q9NS71 199 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.47■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 LEFTY2O00292 366 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CES2O00748 559 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PAGE1O75459 146 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PRLRP16471 622 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 HTR7P34969 479 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 MARCKSL1P49006 195 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CDH6P55285 790 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 COPS2P61201 443 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 E2F7Q96AV8 911 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 C1orf74Q96LT6 269 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 CALN1Q9BXU9 219 aa15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTCFL-210ENST00000481655 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 E2F8A0AVK6 867 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 H3BRJ5 948 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 ACSL4O60488 711 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 TCF3P15923 654 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 KDELR1P24390 212 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 L1CAMP32004 1257 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 TUBB2AQ13885 445 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 LRRC31Q6UY01 552 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 VSIG1Q86XK7 387 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 DENND1CQ8IV53 801 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 TTC16Q8NEE8 873 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 SUSD6Q92537 303 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 ALG3Q92685 438 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 PSMB7Q99436 277 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 ZNF670Q9BS34 389 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.45■□□□□ 0.06
CTCFL-210ENST00000481655 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms