RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 HEY2Q9UBP5 337 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF536O15090 1300 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 UBE4BO95155 1302 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.4□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TNKSO95271 1327 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CFAP69A5D8W1 941 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SMIM23A6NLE4 172 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NOTOA8MTQ0 251 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 METTL12A8MUP2 240 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA8RI6L899 631 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 EPHB6O15197 1021 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ACOX3O15254 700 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MAGEB3O15480 346 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 THAP12O43422 761 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SUSD5O60279 629 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SNAP91O60641 907 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KLHL2O95198 593 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ALDH1A1P00352 501 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 THRAP10827 490 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FOSL1P15407 271 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.233e-7■□□□□ 9.6
PKP4-211ENST00000481115 AOC1P19801 751 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NME2P22392 152 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MSX1P28360 303 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CASP1P29466 404 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 L1CAMP32004 1257 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CA8P35219 290 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ADD2P35612 726 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SOX18P35713 384 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GRIK1P39086 918 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PTPN5P54829 565 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB16Q05516 673 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 WASHC5Q12768 1159 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 POU4F2Q12837 409 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MTMR1Q13613 665 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CCINQ13939 588 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DPYSQ14117 519 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 OXA1LQ15070 435 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LONRF1Q17RB8 773 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SFT2D3Q587I9 215 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FAM209AQ5JX71 171 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TTC30AQ86WT1 665 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PRELID2Q8N945 189 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SUN5Q8TC36 379 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MGARPQ8TDB4 240 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NXPE3Q969Y0 559 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 RANBP9Q96S59 729 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRABDQ9H4I3 376 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CNGB3Q9NQW8 809 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 VPS28Q9UK41 221 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 APPL1Q9UKG1 709 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.38□□□□□ -1.23
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