RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 CD207Q9UJ71 328 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 A0A1B0GUL7 405 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 WDR27A2RRH5 827 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 WDR91A4D1P6 747 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 LINC01553A4QN01 128 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 SGTAO43765 313 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 STRNO43815 780 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 CSF1RP07333 972 aa6.75□□□□□ -1.33
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RBM39-232ENST00000481037 NXPH1P58417 271 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 KRTAP10-9P60411 292 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 MC2RQ01718 297 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 ITIH3Q06033 890 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PIGFQ07326 219 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PLS1Q14651 629 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 ZNF425Q6IV72 752 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PPM1NQ8N819 430 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 RAB24Q969Q5 203 aa6.75□□□□□ -1.33
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RBM39-232ENST00000481037 SPC25Q9HBM1 224 aa6.75□□□□□ -1.33
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RBM39-232ENST00000481037 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 E7ENX8 843 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 SLC43A1O75387 559 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PGK2P07205 417 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 CYP2C9P11712 490 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 TAP2Q03519 686 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 GPM6BQ13491 265 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 GCKRQ14397 625 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.335e-7■□□□□ 10.8
RBM39-232ENST00000481037 PTPN21Q16825 1174 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 HAPLN3Q96S86 360 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 IDI2Q9BXS1 227 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 KLC4Q9NSK0 619 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 MCM3APO60318 1980 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.74□□□□□ -1.33
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RBM39-232ENST00000481037 BEX3Q00994 111 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 ITGA7Q13683 1181 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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RBM39-232ENST00000481037 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 TMIEQ8NEW7 156 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 HDAC10Q969S8 669 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PBKQ96KB5 322 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 RAD9AQ99638 391 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 RTKNQ9BST9 563 aa6.73□□□□□ -1.33
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RBM39-232ENST00000481037 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.73□□□□□ -1.33
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RBM39-232ENST00000481037 RIPK4P57078 832 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 RAB39AQ14964 217 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 LLGL1Q15334 1064 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 EPC2Q52LR7 807 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 ZNF366Q8N895 744 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-232ENST00000481037 PDPRQ8NCN5 879 aa6.72□□□□□ -1.33
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