RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 RBSNQ9H1K0 784 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-218ENST00000479554 PIK3R2O00459 728 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TSPAN3O60637 253 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 KCNK5O95279 499 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 LATS1O95835 1130 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CALCAP01258 141 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ITPKAP23677 461 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HOXD12P35452 270 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 IL12RB1P42701 662 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 IRX4P78413 519 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TYRO3Q06418 890 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 LMAN2Q12907 356 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DEFB119Q8N690 84 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 IRGQQ8WZA9 623 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA1Q92805 767 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HSFY1Q96LI6 401 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CIPCQ9C0C6 399 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 LTFP02788 710 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CFIP05156 583 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF132P52740 706 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ARID5AQ03989 594 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF33AQ06730 810 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FUT11Q495W5 492 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CEP76Q8TAP6 659 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 NDUFS2O75306 463 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 GABBR2O75899 941 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FBXO21O94952 628 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 KRT5P13647 590 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ENGP17813 658 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MAPK8P45983 427 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ENPP2Q13822 863 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF234Q14588 700 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ADGRF1Q5T601 910 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MIS12Q9H081 205 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CD93Q9NPY3 652 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ST7Q9NRC1 585 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TIMM44O43615 452 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 IGLV3-27P01718 113 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PRKCHP24723 683 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 PMLP29590 882 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SLC11A2P49281 568 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM215Q68D42 235 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 MED7O43513 233 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 EPHX1P07099 455 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 NCAM1P13591 858 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 CD6P30203 668 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 HLA-FP30511 346 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 ACADSBP45954 432 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 SGSHP51688 502 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-218ENST00000479554 TBX4P57082 545 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms