RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLD5Q8N7P1 536 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CWH43Q9H720 699 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COX16Q9P0S2 106 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PAK5Q9P286 719 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MTMR11A4FU01 709 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EPOPA6NHQ4 379 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MTSS1O43312 755 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TBC1D4O60343 1298 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPFIA2O75334 1257 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SASH3O75995 380 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGEF15O94989 841 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OR4Q2P0C623 313 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00271P0C7V0 271 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RARGP13631 454 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLRC2P26717 231 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ELF1P32519 619 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPP3CCP48454 512 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PMS2P54278 862 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TPI1P60174 286 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPS1Q13098 491 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLD1Q13393 1074 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PPP2R5DQ14738 602 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 VEPH1Q14D04 833 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TAF12Q16514 161 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DENND2CQ68D51 928 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HOOK3Q86VS8 718 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC185Q8N715 623 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EDEM1Q92611 657 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FBXO32Q969P5 355 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HAPLN3Q96S86 360 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRANK1O15050 2925 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CREB3O43889 395 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 APOEP02649 317 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FYNP06241 537 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ECHS1P30084 290 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ALDH1A3P47895 512 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COG7P83436 770 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DSG1Q02413 1049 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADCY2Q08462 1091 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MMRN1Q13201 1228 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 P3H1Q32P28 736 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RTP2Q5QGT7 225 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FIBCD1Q8N539 461 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 STKLD1Q8NE28 680 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TTC25Q96NG3 672 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC77Q9BR77 488 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLC2Q9H0B6 622 aa14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms