RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT12Q8IV01 421 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD6Q8NC69 237 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NPIPB3Q92617 1050 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SAAL1Q96ER3 474 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NEU1Q99519 415 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CLPBQ9H078 707 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10A4Q9H209 315 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.362e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-209ENST00000473406 F5H697 171 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FURINP09958 794 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCD1P33897 745 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 DGKQP52824 942 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SCARB2Q14108 478 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NAA25Q14CX7 972 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MED22Q15528 200 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RNFT2Q96EX2 444 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PERPQ96FX8 193 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 EYA3Q99504 573 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PIP5K1AQ99755 562 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNK12Q9HB15 430 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CD207Q9UJ71 328 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 IRAK3Q9Y616 596 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3D21A4FU49 640 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 LIPT2A6NK58 231 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 M0QZQ0 153 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC14BO60729 498 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGGTB-209ENST00000473406 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TGFB3P10600 412 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PEPDP12955 493 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MUTP22033 750 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FGFR4P22455 802 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GCH1P30793 250 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ICAM3P32942 547 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD11B2P80365 405 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CBFBQ13951 182 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNJ12Q14500 433 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ST3GAL2Q16842 350 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 LY6KQ17RY6 165 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 METRNLQ641Q3 311 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MON1AQ86VX9 555 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FRMD1Q8N878 549 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MB21D1Q8N884 522 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GTW7 788 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 GRM8O00222 908 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2CO00762 179 aa6.52□□□□□ -1.37
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