RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 COL6A3P12111 3177 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 E2F8A0AVK6 867 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.31■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 ASGR2P07307 311 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 CCR1P32246 355 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 AIF1P55008 147 aa20.31■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 NXPE3Q969Y0 559 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 WDCPQ9H6R7 721 aa20.31■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 ALG6Q9Y672 507 aa20.31■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 PRPSAP2O60256 369 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 IGLV3-27P01718 113 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 KLKB1P03952 638 aa20.3■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 HTR3DQ70Z44 454 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 FAM131BQ86XD5 332 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 C5orf42Q9H799 3197 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 LRCH4O75427 683 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 HDAC4P56524 1084 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 AMFRQ9UKV5 643 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 GREM1O60565 184 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 KRT7P08729 469 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 COMTP21964 271 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 GDI1P31150 447 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 IFNAR2P48551 515 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 BOLA3Q53S33 107 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 PEX26Q7Z412 305 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 USP18Q9UMW8 372 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 MIPP30301 263 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 SLC11A2P49281 568 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC38Q5VT99 294 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 Q6ZNB5 142 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 NTAN1Q96AB6 310 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.27■□□□□ 0.84
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.27■□□□□ 0.84
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SNHG12-201ENST00000461448 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.27■□□□□ 0.83
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SNHG12-201ENST00000461448 TUBB4AP04350 444 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 AZIN2Q96A70 460 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 BRD9Q9H8M2 597 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 PSTPIP1O43586 416 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 ACSL4O60488 711 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG12-201ENST00000461448 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.26■□□□□ 0.83
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