RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM11	Q96F44	468 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC7	Q99615	494 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DDIT4	Q9NX09	232 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DEC1	Q9P2X7	70 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO10	Q9UK96	956 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ATG13	O75143	517 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GRAP2	O75791	330 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	APOD	P05090	189 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TYR	P14679	529 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ABCB4	P21439	1286 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF4	P43489	277 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	E2F5	Q15329	346 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ANO4	Q32M45	955 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RNF43	Q68DV7	783 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	BNIPL	Q7Z465	357 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM5	Q9C035	493 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RTN2	O75298	545 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TULP3	O75386	442 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ENDOD1	O94919	500 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KAT7	O95251	611 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MYBL1	P10243	752 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	KRT3	P12035	628 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PTPN9	P43378	593 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CXCR3	P49682	368 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CCR3	P51677	355 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FYB2	Q5VWT5	728 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CNGA4	Q8IV77	575 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM32	Q8TC27	787 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RBSN	Q9H1K0	784 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD62	A6NC57	917 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241		M0QYT0	321 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02	7e-19	■■■■□ 25.2
PTPA-222	ENST00000445241	EGF	P01133	1207 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DES	P17661	470 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	SDC4	P31431	198 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FLT3	P36888	993 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PTPN5	P54829	565 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	C12orf40	Q86WS4	652 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TERB1	Q8NA31	727 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DDI1	Q8WTU0	396 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	RNF34	Q969K3	372 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ACD	Q96AP0	544 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ISCU	Q9H1K1	167 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	PARVA	Q9NVD7	372 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTPA-222	ENST00000445241	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		15.18	■□□□□ 0.02

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