RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 E5RJQ4 531 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIK3R2O00459 728 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CACNG3O60359 315 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSF2BPO75031 334 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KAT7O95251 611 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLV3-27P01718 113 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLKB1P03952 638 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FYNP06241 537 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP1A3P13637 1013 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GBP1P32455 592 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CNR2P34972 360 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCNN1AP37088 669 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC11A2P49281 568 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBX4P57082 545 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC6A3Q01959 620 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANO4Q32M45 955 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MPPE1Q53F39 396 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADGRF1Q5T601 910 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYT13Q7L8C5 426 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERICH1Q86X53 443 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DENND1CQ8IV53 801 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C18orf8Q96DM3 657 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BBS2Q9BXC9 721 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYNCQ9H7C4 482 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXO10Q9UK96 956 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1B0GTH6 734 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 K7EQS6 105 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPC1O15118 1278 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IRAK2O43187 625 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TIMM44O43615 452 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TULP3O75386 442 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SERPINC1P01008 464 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HMBSP08397 361 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC2A3P11169 496 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TYRP14679 529 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOS2P35228 1153 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC6A11P48066 632 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDK17Q00537 523 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDR2Q01850 454 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NR1I3Q14994 352 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MPP7Q5T2T1 576 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARCQ7LC44 396 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USP33Q8TEY7 942 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IQCDQ96DY2 449 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC39A13Q96H72 371 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPXM1Q96SM3 734 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUP58Q9BVL2 599 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CBX8Q9HC52 389 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.47□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COL4A3Q01955 1670 aa8.46□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.46□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-216ENST00000437713 K7ESF4 209 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms