RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	PALB2	Q86YC2	1186 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX9	Q8N6V9	391 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	LMO3	Q8TAP4	145 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CASP10	Q92851	521 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SKA1	Q96BD8	255 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZBTB9	Q96C00	473 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	IQCD	Q96DY2	449 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CORO1B	Q9BR76	489 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	MED10	Q9BTT4	135 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SDCBP2	Q9H190	292 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CISH	Q9NSE2	258 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	IRAK3	Q9Y616	596 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRCA2	P51587	3418 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIDE1	A8MVS5	230 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638		F8VZ95	297 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRRG1	O14668	218 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	PER2	O15055	1255 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX33	O43247	280 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	MED7	O43513	233 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TSPAN6	O43657	245 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SGTA	O43765	313 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CILP	O75339	1184 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4Q2	P0C623	313 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	NCAM1	P13591	858 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	UCHL3	P15374	230 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANXA13	P27216	316 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	STAT1	P42224	750 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	BPIFB4	P59827	614 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ROR1	Q01973	937 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYP27A1	Q02318	531 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADCY1	Q08828	1119 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	INCA1	Q0VD86	236 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB33A	Q14088	237 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRIM14	Q14142	442 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	NR1I3	Q14994	352 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAF12	Q16514	161 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUSP6	Q16828	381 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CFAP58	Q5T655	872 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TPGS2	Q68CL5	300 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	GJB7	Q6PEY0	223 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SARM1	Q6SZW1	724 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM270	Q6UE05	265 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	NACC2	Q96BF6	587 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYRFL	Q96LU7	910 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERINC2	Q96SA4	455 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		6.49	□□□□□ -1.37
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.49	□□□□□ -1.37

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