RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PBX3P40426 434 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 IGBP1P78318 339 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 ADCY1Q08828 1119 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 NEDD9Q14511 834 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC6Q16204 474 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 RGS18Q9NS28 235 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 C4orf47A7E2U8 309 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 ANHXE9PGG2 379 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 CBX4O00257 560 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 ADCY2Q08462 1091 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF174Q15697 407 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 MTSS1LQ765P7 747 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 RNF169Q8NCN4 708 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D5Q92609 795 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 SLC32A1Q9H598 525 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 ING3Q9NXR8 418 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-211ENST00000429595 ABCB11O95342 1321 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRK-211ENST00000429595 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 INPPL1O15357 1258 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 OPA1O60313 960 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 GAAP10253 952 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 GNAT2P19087 354 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SP2Q02086 613 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 UBE3CQ15386 1083 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 EDEM2Q9BV94 578 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 ZBP1Q9H171 429 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 POFUT1Q9H488 388 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CLMPQ9H6B4 373 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.96□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 PXMP2Q9NR77 195 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 FRYLO94915 3013 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PATJQ8NI35 1801 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CAPN8A6NHC0 703 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 H0Y626 953 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CAPN9O14815 690 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM16O95361 564 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD16AO95870 558 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MYBP10242 640 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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