RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 PI4KAP42356 2102 aa21.91■■□□□ 1.1
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LIMS1-208ENST00000428064 C7P10643 843 aa21.9■■□□□ 1.1
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LIMS1-208ENST00000428064 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.9■■□□□ 1.1
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LIMS1-208ENST00000428064 MORC3Q14149 939 aa21.89■■□□□ 1.09
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LIMS1-208ENST00000428064 PMF1Q6P1K2 205 aa21.89■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PIP4P1Q86T03 277 aa21.89■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC32A1Q9H598 525 aa21.89■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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LIMS1-208ENST00000428064 GNA14O95837 355 aa21.88■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 SYPP08247 313 aa21.88■■□□□ 1.09
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LIMS1-208ENST00000428064 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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LIMS1-208ENST00000428064 GNSP15586 552 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 PRKCHP24723 683 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 TPMTP51580 245 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 ARID5AQ03989 594 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 KCNH2Q12809 1159 aa21.86■■□□□ 1.09
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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