RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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PTPRU-204ENST00000428026 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 KRT36O76013 467 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 ETS2P15036 469 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 XRCC4Q13426 336 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 ALFQ53S48 1182 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-204ENST00000428026 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.83□□□□□ -0.04
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