RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426056.1

GET4-204, Transcript of golgi to ER traffic protein 4, human

TSL 4

Gene GET4, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GET4-204	ENST00000426056	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	GMIP	Q9P107	970 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	YIPF1	Q9Y548	306 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	AGPS	O00116	658 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SMAP	O00193	183 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	MFSD11	O43934	449 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SEC24A	O95486	1093 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	CDR1	P51861	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	GDF10	P55107	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	DYNLT1	P63172	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	RING1	Q06587	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	NME3	Q13232	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	MTMR3	Q13615	1198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	P3H1	Q32P28	736 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	P3H4	Q92791	437 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62	2e-6	■■■■□ 26
GET4-204	ENST00000426056	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GET4-204	ENST00000426056	WASH4P	A8MWX3	477 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056		H0YGN5	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	FGF18	O76093	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	C1R	P00736	705 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	NUDT17	P0C025	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	CSH1	P0DML2	217 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	CSH2	P0DML3	217 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	AMPD1	P23109	780 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	CCR1	P32246	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	TUB	P50607	506 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	ITGA8	P53708	1063 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	PLTP	P55058	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	GBE1	Q04446	702 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	TAF10	Q12962	218 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	MTA1	Q13330	715 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	FAM72B	Q86X60	149 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	EPAS1	Q99814	870 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	KLC2	Q9H0B6	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GET4-204	ENST00000426056	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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