RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420095.1

LMCD1-AS1-201, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 2,144 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KYNUQ16719 465 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TUBB8Q3ZCM7 444 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PYROXD2Q8N2H3 581 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC7A14Q8TBB6 771 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRIM62Q9BVG3 475 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CENPHQ9H3R5 247 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FBXW11Q9UKB1 542 aa12.37□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TNFRSF10BO14763 440 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HOXA2O43364 376 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TADA2AO75478 443 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AMPD1P23109 780 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MFSD5Q6N075 450 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 C4orf22Q6V702 233 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MFN1Q8IWA4 741 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRIM42Q8IWZ5 723 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TTC25Q96NG3 672 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RNF208Q9H0X6 261 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SAYSD1Q9NPB0 183 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PAK5Q9P286 719 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HEY1Q9Y5J3 304 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PTPRDP23468 1912 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PATJQ8NI35 1801 aa12.36□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 172.3
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HACD1B0YJ81 288 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RASGRF2O14827 1237 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DGKIO75912 1065 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NCAM1P13591 858 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GOT1P17174 413 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HCAR3P49019 387 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CXCR3P49682 368 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NME3Q13232 169 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 EFHC2Q5JST6 749 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ANKRD22Q5VYY1 191 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BSPRYQ5W0U4 402 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CENPUQ71F23 418 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ABI1Q8IZP0 508 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RNF139Q8WU17 664 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SERPINB12Q96P63 405 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 33.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TMEM165Q9HC07 324 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARHGEF4Q9NR80 690 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LRFN2Q9ULH4 789 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ACSL3O95573 720 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AGTP01019 485 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RBL1P28749 1068 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RANBP1P43487 201 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GBE1Q04446 702 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SEMA3BQ13214 749 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AUHQ13825 339 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DPYSQ14117 519 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TOX2Q96NM4 488 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 OLFM3Q96PB7 478 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CAPS2Q9BXY5 557 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ADAM28Q9UKQ2 775 aa12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 OR6C75A6NL08 312 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 E7ESA3 106 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KCNN4O15554 427 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 IGLV3-25P01717 112 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ALDH2P05091 517 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NAT1P18440 290 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FGFR3P22607 806 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MAGEA6P43360 314 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MAGEA11P43364 429 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC11A1P49279 550 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GATMP50440 423 aa12.34□□□□□ -0.43
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARL4CP56559 192 aa12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms