RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDI1Q8WTU0 396 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPLX3Q8WVH0 158 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AZIN2Q96A70 460 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HAUS4Q9H6D7 363 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLK2Q9NYY3 685 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COX16Q9P0S2 106 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H0Y858 1186 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 M0QYT0 321 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GFRA3O60609 400 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATG13O75143 517 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GYPCP04921 128 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCR1P32246 355 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SULT1E1P49888 294 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSCP56915 257 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NME3Q13232 169 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM14Q14142 442 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAS6Q14393 721 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPPE1Q53F39 396 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FYB2Q5VWT5 728 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARCQ7LC44 396 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF34Q969K3 372 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYT11Q9BT88 431 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.04■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F5P12259 2224 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D3BA6NDS4 549 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCB4P21439 1286 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DGKGP49619 791 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTP4A2Q12974 167 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTA1Q13330 715 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACAD10Q6JQN1 1059 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MON1BQ7L1V2 547 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TERB1Q8NA31 727 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACDQ96AP0 544 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTN2A3PQ96KV6 586 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPY6RQ99463 290 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM51Q9NW97 253 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 K7EQS6 105 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPAN3O60637 253 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TPM1P09493 284 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FLT3P36888 993 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBL1P41271 181 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFRSF4P43489 277 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXCL12P48061 93 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC13P55735 322 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MESP2Q0VG99 397 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C10orf76Q5T2E6 689 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS36Q86VN1 386 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C3orf20Q8ND61 904 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.02■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.02■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A0A0MRY4 1105 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GFRA2O00451 464 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F9P00740 461 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPING1P05155 500 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT3P12035 628 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SKILP12757 684 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC6A4P31645 630 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CASP14P31944 242 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEUP1Q05D60 604 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPP7Q5T2T1 576 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.01■□□□□ 0.47
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms