RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 ASAH2Q9NR71 780 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DDIT4Q9NX09 232 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP69A5D8W1 941 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RASA4BC9J798 803 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANGPT2O15123 496 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RASA4O43374 803 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MFAP3LO75121 409 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RTN2O75298 545 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL18O94889 574 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ACRP10323 421 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX5P17844 614 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 YWHAQP27348 245 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ETFBP38117 255 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PTENP60484 403 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP24A1Q07973 514 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EFEMP1Q12805 493 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPN21Q16825 1174 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL38Q2WGJ6 581 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PLPP4Q5VZY2 271 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MIEF2Q96C03 454 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 VMP1Q96GC9 406 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TEPSINQ96N21 525 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EPC1Q9H2F5 836 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CERS4Q9HA82 394 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C5P01031 1676 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SNTNA6NMZ2 147 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LACTBL1A8MY62 500 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GRAP2O75791 330 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL2O95198 593 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANP32DO95626 131 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FTCDO95954 541 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RALBP11234 206 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BRAFP15056 766 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 UCHL3P15374 230 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GLRA2P23416 452 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MDH1P40925 334 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MYL6P60660 151 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BTN3A2P78410 334 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2H3Q13889 308 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRADDQ15628 312 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMD5Q16401 504 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF19Q2TAC6 998 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C2CD6Q53TS8 623 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC51AQ86UW1 340 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 STK32CQ86UX6 486 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATL2Q8NHH9 583 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PPCSQ9HAB8 311 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMCO1Q9UM00 188 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GABRQQ9UN88 632 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LRCH1Q9Y2L9 728 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KANSL1LA0AUZ9 987 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TK2O00142 265 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PSTPIP1O43586 416 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ALBP02768 609 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms